Cell | 染色质激活或诱发状态决定了核小体分离的差异性

2021-10-13 17:24:15 来源:
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肝细胞内部结构通过倡导或抑制该内部结构的转录可以压制遗传基因组的功能性和细胞身份推定。这些肝细胞内部结构中会存在特定的遗传基因物质翻译后结构上(posttranslational modifications,PTMs),它们与特定转录静止状态涉及,并可倡导选择性染色体内部结构的形成,影响遗传基因的表达出来。为了在细胞器时依然保持遗传表型出来程序的完整性,决定肝细胞内部结构的水分子特征也须要在子代细胞中会建起。建起不同类M-肝细胞静止状态的重要密切相关是遗传基因物质PTMs,主要存在于遗传基因物质H3和H4的尾巴上。因此,在细胞器的过程中会,除了DNA脱氧核糖核酸,表M-核小体也须要扩建,并分派到子代细胞中会。确实,数据分析推断出表M-的当代遗传基因物质(比如脱氧核糖核酸依赖的遗传基因物质)会在脱氧核糖核酸长柄后迅速再组装。不同的数据分析组推断出H3K9me3和H3K27me2/3可通过有丝分裂遗传基因。然而,这两个遗传基因物质结构上都是与选择性肝细胞内部结构涉及。那么,表M-中会的核小体,以及它们携带的遗传基因物质PTMs是否都能遗传基因到子代细胞相同的遗传基因观众席上呢?来自纽约大学兰戈恩医学中会心的Danny Reinberg教授课题组在Cell发表数据分析Active and Repressed Chromatin Domains Exhibit Distinct Nucleosome Segregation during DNA Replication,该数据分析推断出在DNA脱氧核糖核酸时,转录与颇受抑制肝细胞范围内的核小体转化是不同的。颇受抑制肝细胞内部结构中会的核小体会被送至在子代细胞相同的遗传基因范围内,而转录M-肝细胞内部结构中会的核小体的分派则是弥散和随机的。为数据分析核小体的转化情况下,数据分析者在候选遗传基因观众席不可逆的记号遗传基因物质H3.1和H3.2,以追踪肠道生殖生殖中会核小体在细胞器时的变化。最简单来说,该方法通过邻近细胞内记号技术,利用CRISPR为特定遗传基因观众席的H3.1和H3.2随身携带谷氨酸记号,经ChIP-qPCR侦测该谷氨酸记号在细胞周期G1期和S期的重元素,以反应会核小体的转化情况下。若该核糖体H3.1和H3.2上的谷氨酸记号在一次细胞器后降低一半,说明该核小体被送至在了两个子代细胞的相同遗传基因观众席上;若该谷氨酸结构上很快消失,说明子代细胞不曾遗传基因该遗传基因观众席的核小体。数据分析者首先侦测了在生殖生殖中会无论如何表达出来的Hoxc6, Ebf1, Meis2遗传基因的核小体转化情况下。这些遗传基因观众席的核小体谷氨酸水平随细胞器逐渐减半,这高亮颇受抑制的遗传基因观众席的核小体会被送至在子代细胞的相同方位。这与前人推断出的H3K9me3和H3K27me2/3可通过有丝分裂遗传基因的周期性相可知。那么,转录M-肝细胞范围内的核小体又是如何转化的呢?数据分析者侦测了在生殖生殖中会被转录表达出来的Ccna2, Nanog和Pou5f1遗传基因,推断出该遗传基因观众席的谷氨酸记号在细胞器后呈弥散静止状态,重元素太低,这高亮对于转录M-肝细胞范围内来说,表M-核小体没有精确的分派到子代细胞相应的遗传基因观众席,而是随机分派的。格外有趣的是,在其会生殖生殖分化时,Hoxc6遗传基因由抑制转入转录,它的核小体分派模式也由精确的同核糖体分派改为随机分派。这说明表M-核小体的发散分派,可以反映该肝细胞范围内的活性静止状态。总的来说,该数据分析通过CRISPR正向的遗传基因物质谷氨酸记号系统会,数据分析了核小体在细胞器过程中会的分派方式,并推断出转录与颇受抑制的肝细胞范围内的核小体分派方式的不同。在在的是,在细胞周期的S期中会,颇受抑制的肝细胞范围内的脱氧核糖核酸要晚于转录M-肝细胞范围内。这个时间差异也致使常肝细胞的脱氧核糖核酸速率大于异肝细胞。异肝细胞相比较较慢的脱氧核糖核酸速度确实保证了核小体的精确分派,而常肝细胞中会的PTMs则由相应的主调节因子(master regulators)直接辨别相应DNA基因序列,并招揽PTMs酶再建起。格外早出处:Escobar TM1, Oksuz O1, Salda?a-Meyer R1, et al.Active and Repressed Chromatin Domains Exhibit Distinct Nucleosome Segregation during DNA Replication.Cell. 2019 Oct 31;179(4):953-963.e11. doi: 10.1016/j.cell.2019.10.009.
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