Sci Rep:5-miRNA标签特征可作为食管鳞状细胞癌的预后生物多种类型

2022-01-31 06:09:10 来源:
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这项研究旨在确定一种可以得出食管表皮蛋白质癌(ESCC)病患者总体几率(OS)的miRNAs标识。

从NCBI GEO获得119名ESCC病患者的miRNA表达出来谱及其附加的流行病学反馈,并将其作为特训集。在早期和早期采样间筛选差异表达出来的miRNAs(DEmiRNAs)。使用Cox回归量化、迭代特征抑制(RFE)-反对向量机(SVM)解法和LASSO Cox回归模型来标识几率特质miRNAs,从而建起几率评价模型。此外,得出了这些几率特质miRNAs的有忧虑靶遗传,然后构建了miRNA靶遗传的网络。通过功能富含量化,量化了ESCC中这些几率特质miRNAs得出靶遗传的功能连续特质。

在特训分散,早期与早期采样有46个DEmiRNAs。建起了基于5个miRNAs的效用评价模型。该5-miRNA效用评价可以将特训集分为OS时间明显不同的高危组和低危组。在一个来自胃癌遗传组图集(TCGA)的脱离数据分散,事与愿违验证了5-miRNA效用评价的效用分层控制能力。已确定了与这些miRNAs关的的各种生态学过程和闭环,例如Wnt瞬时闭环、TRP通道的炎症介质调节闭环和雌激素瞬时闭环。

这项研究提示,与病变应于关的的5-miRNA标识对得出ESCC病患者的几率具有流行病学意义。

原始出处:

JunYu. Characterization of a five-microRNA signature as a prognostic biomarker foresophageal squamous cell carcinoma. Sci Rep. 27 December 2019.

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